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Nf04_2014 - Gottschalk, Alexander

Zellspezifisches mRNAProfiling des Nozizeptorneurons PVD, mit optogenetischer Analyse von PVD Defekten nach knockdown der Kandidatengene.mRNAs aus PVD können spezifisch durch pulldown eines spezifisch in PVD exprimierten, FLAG-tag markierten polyA bindenden Proteins (grün) isoliert werden. Als Vergleich werden mRNAs aus anderen Geweben isoliert, und beide per Microarray oder RNAseq analysiert und ermittelt, welche mRNAs im Vergleich zur Kontrolle signifikant in PVD angereichert sind. Diese Gene können durch RNAi transient in ihrer Expression unterdrückt werden, die resultierenden Tiere werden in einem optogenetischen Assay analysiert um Defekte in PVD zu ermitteln. Positive Kandidaten werden dann weiter untersucht und z.B. spezifisch nur in PVD eliminiert. Aus Husson et al. (2012).

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